Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,374,810	C→T	G396G (GGC→GGT)	ycjN →	predicted sugar transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,374,810	0	C	T	100.0%	174.7 / NA	93	G396G (GGC→GGT)	ycjN	predicted sugar transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (93/0);  total (93/0)

GATGTGACGGGTTCTGGCGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGTAAAGCCGA  >  W3110S.gb/1374793‑1374854                  |                                             gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTTAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:6552/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTg                            >  1:71591/1‑36 (MQ=37) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCAt                         >  1:75682/1‑39 (MQ=37) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGt                    >  1:633/1‑44 (MQ=38) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGcc    >  1:85204/1‑60 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:34092/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:82430/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:30788/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:83725/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:81286/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:28179/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:43500/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:21569/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:85640/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:85907/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:41964/1‑61 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:74915/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:73760/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:76107/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:73756/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:71616/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:73649/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:73540/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:81100/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:70871/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:68072/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:64501/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:62636/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:59876/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:59659/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:84389/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:9831/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:8893/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:88560/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:87177/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:85444/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:8539/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:84561/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:84469/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:84391/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:76981/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:83000/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:8235/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:82268/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:55078/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:81057/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:80868/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:80517/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:79415/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:26420/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:59387/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:39111/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:3822/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:35371/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:34591/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:34434/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:32811/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:31054/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:2926/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:28774/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:40202/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:2565/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:25513/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:23532/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:17925/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:17833/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:17405/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:16648/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:14594/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:12811/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:49495/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:57376/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:56626/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:1229/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:54964/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:54461/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:53152/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:52694/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:52379/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:49845/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:40697/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:49308/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:49014/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:46447/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:45396/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:44693/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:42916/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:42387/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:42254/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:41491/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAATCGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCGa  >  1:29249/1‑62 (MQ=255) gATGTGACGGGGTCTGGTGTGGTGAGTTCAAAGGAGCATAACGTCACCGTggg           >  1:69195/1‑53 (MQ=255) gATGTGACGGGGACTGGTGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGGAAAGCCg   >  1:22409/1‑61 (MQ=255)                  |                                             GATGTGACGGGTTCTGGCGTGGTGAGTTCAATGGTGCATAACGTCACCGTGGGTAAAGCCGA  >  W3110S.gb/1374793‑1374854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑