Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,467,004	A→G	intergenic (+229/‑102)	paaY → / → ydbA	predicted hexapeptide repeat acetyltransferase/ECK1398:JW5802:b1401; predicted outer membrane protein, N‑ter fragment

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,467,004	0	A	G	100.0%	110.7 / NA	58	intergenic (+229/‑102)	paaY/ydbA	predicted hexapeptide repeat acetyltransferase/ECK1398:JW5802:b1401; predicted outer membrane protein, N‑ter fragment
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/58);  total (0/58)

TGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGT  >  W3110S.gb/1466997‑1467058        |                                                       tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:63430/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:42781/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:11606/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:48423/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:521/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:56202/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:56880/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:57715/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:59051/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:59996/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:60450/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:62658/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:63147/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:63309/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:46126/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:6363/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:65769/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:70098/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:74527/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:75283/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:76727/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:77176/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:82685/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:82756/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:84933/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:8701/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:87480/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:9194/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:40332/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:1215/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:13004/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:13889/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:14354/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:15887/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:16861/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:17359/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:18866/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:18938/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:20372/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:20755/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:22281/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:25805/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:4008/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:39756/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:38437/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:31899/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:30716/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:30688/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:29445/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:2862/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:28442/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:27305/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:23674/62‑1 (MQ=255) tGATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGGCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:40576/62‑1 (MQ=255)  gATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:73485/61‑1 (MQ=255)  gATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:72506/61‑1 (MQ=255)  gATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:20740/61‑1 (MQ=255)  gATTAGGTAACAATCTACTGGCAATATTGGACGTCCTCTATGTTTTAAATAATCAATTGGt  <  1:64630/61‑1 (MQ=255)        |                                                       TGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGT  >  W3110S.gb/1466997‑1467058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑