Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 163,655 A→G G517G (GGA→GGG)  hrpB → predicted ATP‑dependent helicase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb163,6550AG100.0% 211.7 / NA 107G517G (GGA→GGG) hrpBpredicted ATP‑dependent helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/107);  total (0/107)

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

TGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACG  >  W3110S.gb/163616‑163677
                                       |                      
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGTGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:72090/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:53383/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:65324/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:64357/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:63545/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:63289/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:62950/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:62558/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:61727/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:61224/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:57241/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:56404/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:55126/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:65949/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:53233/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:52492/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:51606/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:51402/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:51308/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:51118/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:50953/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:50007/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:49568/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:10335/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:48009/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:73459/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:87946/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:87536/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:87471/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:87408/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:84418/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:83634/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:81952/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:78173/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:77638/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:75406/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:74798/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:48374/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:72429/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:72369/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:7169/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:6876/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:68048/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:67989/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:67650/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:67209/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:66897/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:66023/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:21120/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:29324/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:46342/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:27293/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:26994/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:26854/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:25947/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:23912/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:22980/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:22539/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:21909/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:21192/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:28322/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:20630/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:20258/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:1861/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:18181/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:16708/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:14782/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:14048/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:12127/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:11906/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:11196/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:10678/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:39617/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:46099/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:44466/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:44042/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:42698/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:41796/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:41166/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:40291/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:40099/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:40025/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:39699/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:30550/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:39493/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:39240/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:38978/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:37047/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:37032/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:35444/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:34035/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:32044/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:31161/62‑3 (MQ=255)
tGGGCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:31037/62‑3 (MQ=255)
 gggCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:54361/61‑3 (MQ=255)
   gCAAGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:79248/59‑3 (MQ=255)
     aaGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:22800/57‑3 (MQ=255)
     aaGATGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:79797/57‑3 (MQ=255)
        aTGAACGCTATCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:1825/54‑3 (MQ=255)
                  tCAACTGGCGAACGGCATGGGGGCGATGCTCGATGCcgacgatg  <  1:61902/44‑3 (MQ=25)
                                       |                      
TGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACG  >  W3110S.gb/163616‑163677

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑