Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 1,509 | A→G | A391A (GCA→GCG) | thrA → | fused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 1,509 | 0 | A | G | 98.6% | 125.7 / ‑7.1 | 69 | A391A (GCA→GCG) | thrA | fused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (68/0); minor base C (1/0); total (69/0) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAGGCTTACTGGAGCCGCTGGCAGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCGGTGGTAGGTGAT > W3110S.gb/1487‑1548 | aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCa > 1:87418/1‑42 (MQ=37) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTAtct > 1:11983/1‑48 (MQ=38) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:53135/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:6527/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:6526/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:63621/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:6148/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:60633/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:60400/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:59908/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 1:54981/1‑55 (MQ=255) aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt > 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |