Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,770,687 G→A intergenic (‑288/‑101) ydiJ ← / → ydiK predicted FAD‑linked oxidoreductase/predicted inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,770,6870GA97.4% 67.1 / NA 39intergenic (‑288/‑101)ydiJ/ydiKpredicted FAD‑linked oxidoreductase/predicted inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (0/38);  minor base T (0/1);  total (0/39)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

AGAATTAAGGGCAGAATCGGCCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCATT  >  W3110S.gb/1770668‑1770719
                   |                                
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:7086/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:12306/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:51662/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:56840/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:57384/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:63082/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:64619/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:65887/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:66106/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:50882/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:71088/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:71542/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:75903/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:78478/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:80243/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:84147/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:87358/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:88392/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:29419/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:17742/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:20218/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:2146/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:21993/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:23569/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:25254/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:47898/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:30010/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:35504/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:39158/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:40367/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:41786/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:45080/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:46018/52‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACC‑CTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:68189/51‑1 (MQ=255)
aGAATTAAGGGCAGAATCAACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:12690/52‑1 (MQ=39)
 gAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:86055/51‑1 (MQ=255)
 gAATTAAGGGCAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:84083/51‑1 (MQ=255)
           cAGAATCGACCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:18700/41‑1 (MQ=255)
               aTCGTCCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCAtt  <  1:28999/37‑1 (MQ=255)
                   |                                
AGAATTAAGGGCAGAATCGGCCTGTTAAAAACCGCTGAAATTGCTCATCATT  >  W3110S.gb/1770668‑1770719

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑