Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 230,843 C→T S13S (TCG→TCA yafC ← predicted DNA‑binding transcriptional regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb230,8430CT100.0% 116.7 / NA 65S13S (TCG→TCAyafCpredicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/65);  total (0/65)

GTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTCC  >  W3110S.gb/230806‑230867
                                     |                        
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTTAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:86976/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTTAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:31442/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGGAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:42017/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:54752/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:12343/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:5767/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:57947/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:59530/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:59596/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:66585/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:67364/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:69616/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:70636/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:72252/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:72793/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:74273/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:74569/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:75176/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:75317/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:75886/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:76994/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:77715/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:78115/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:80875/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:81609/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:82158/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:83756/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:86775/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:87777/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:9456/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:5234/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:10077/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:12455/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:1544/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:16634/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:19877/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:19944/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:22188/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:2325/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:25965/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:26121/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:27090/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:27924/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:28664/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:29183/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:35015/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:5452/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:40257/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:44348/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:45348/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:47256/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:49445/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:49001/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:49198/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:4924/62‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGACCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:88037/62‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:38897/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:57272/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:87532/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:68247/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:44691/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:73675/61‑1 (MQ=255)
 ttCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGACGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:59025/61‑1 (MQ=255)
   ccGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:46794/59‑1 (MQ=255)
                        cGCTTTCTACGACTGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTcc  <  1:63105/38‑1 (MQ=38)
                                     |                        
GTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTCC  >  W3110S.gb/230806‑230867

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: