Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,039,293	A→G	C333R (TGC→CGT)	yedV ←	predicted sensory kinase in two‑component regulatory system with YedW

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,039,293	0	A	G	100.0%	87.4 / NA	46	C333R (TGC→CGT)	yedV	predicted sensory kinase in two‑component regulatory system with YedW
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/46);  total (0/46)

TCCGCAAAGATTTGCTGATTGCACTCGACCTTAAAGCAAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGGTA  >  W3110S.gb/2039256‑2039317                                      |                         tCCGCAAAGATTTGTTGATT‑CACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:1510/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGTTTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:56602/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGTTTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:83496/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTTAAAGATa  <  1:330/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:66446/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:4958/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:10234/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:53683/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:5721/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:57446/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:57803/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:60038/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:60093/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:52452/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:75121/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:82115/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:82230/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:82897/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:83774/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:85661/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:85887/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:9480/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:21487/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:11080/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:1410/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:15758/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:16415/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:25238/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:29682/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:47194/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:41548/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:41667/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:43281/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:34644/61‑1 (MQ=255)  ccGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:42658/61‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:19751/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:88536/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:12013/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:13747/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:1440/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:54916/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:78102/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:48144/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:62207/60‑1 (MQ=255)   cGCAAAGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:30343/60‑1 (MQ=255)       taGATTTGTTGATTGCACTCGACCTTAAAACGAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGATa  <  1:76510/55‑1 (MQ=255)                                      |                         TCCGCAAAGATTTGCTGATTGCACTCGACCTTAAAGCAAATCTCTTTCTCGTCTGAAAGGTA  >  W3110S.gb/2039256‑2039317

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑