Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	235,164	T→C	L117L (TTG→CTG)	yafS →	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	235,164	0	T	C	100.0%	87.3 / NA	48	L117L (TTG→CTG)	yafS	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/48);  total (0/48)

CATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGG  >  W3110S.gb/235134‑235195                               |                                cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:74700/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:10233/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:54768/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:56473/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:57313/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:58456/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:59451/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:65000/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:66359/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:67029/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:70199/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:72602/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:52491/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:75321/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:75983/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:77/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:80037/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:8159/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:81869/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:82359/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:84436/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:84466/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:86815/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:8810/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:45522/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:14115/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:17964/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:2013/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:20399/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:21307/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:23351/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:24197/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:26130/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:26888/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:32680/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:34704/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:35676/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:35880/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:3775/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:39034/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:39307/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:4326/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:45423/62‑1 (MQ=255) cATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:46897/62‑1 (MQ=255)   tCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:86720/60‑1 (MQ=255)     gTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:29476/58‑1 (MQ=255)     gTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:17997/58‑1 (MQ=255)                       aTCGGGTACTGATTGATGATGGCTGGCTGGTGATTAGTgg  <  1:42662/40‑1 (MQ=38)                               |                                CATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGG  >  W3110S.gb/235134‑235195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑