Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,516,251	T→C	L392L (CTT→CTC)	yfeO →	predicted ion channel protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,516,251	0	T	C	97.6%	76.8 / NA	42	L392L (CTT→CTC)	yfeO	predicted ion channel protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (41/0);  minor base A (1/0);  total (42/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

TATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATC  >  W3110S.gb/2516239‑2516297             |                                               tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGGAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:52246/1‑59 (MQ=39) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAg                     >  1:12987/1‑40 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAAt   >  1:32936/1‑58 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:7946/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:52663/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:52992/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:5347/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:5913/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:67914/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:69868/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:73339/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:78289/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:51354/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:80289/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:8080/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:81572/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:82277/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:83818/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:86162/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:86579/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:897/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:5081/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:12142/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:12370/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:15983/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:18406/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:19149/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:19719/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:21361/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:26100/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:26425/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:32553/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:36614/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:39490/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:42917/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:4412/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:48017/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:48453/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:4981/1‑59 (MQ=255) tATCGTCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:11160/1‑59 (MQ=255) tATCATCATGCTCCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATc  >  1:62248/1‑59 (MQ=255) aaTCGTCATGCTACCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGt                        >  1:78150/2‑37 (MQ=39)             |                                               TATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATC  >  W3110S.gb/2516239‑2516297

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑