Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,698,155	T→G	A247A (GCT→GCG)	yfhH →	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,698,155	0	T	G	77.2%	108.7 / 23.3	79	A247A (GCT→GCG)	yfhH	predicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/18);  new base G (61/0);  total (61/18)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-18
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

CTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAA  >  W3110S.gb/2698142‑2698209              |                                                       ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGa                   >  1:14902/1‑51 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:47501/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:67580/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:66902/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:61863/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:60563/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:60054/1‑52 (MQ=255) ctGCTTGTCACGCGCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGAt                  >  1:55854/1‑52 (MQ=255) 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        cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:68789/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:33764/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:71017/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:21429/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:79702/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:33480/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:5329/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:77262/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:32130/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:25683/60‑1 (MQ=255)         cACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGaa  <  1:26810/60‑1 (MQ=255)              |                                                       CTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAA  >  W3110S.gb/2698142‑2698209

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑