Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	5,887	C→T	P191P (CCG→CCA)	yaaA ←	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	5,887	0	C	T	100.0%	47.6 / NA	28	P191P (CCG→CCA)	yaaA	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (28/0);  total (28/0)

GTAGAAGCTGATGATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCT  >  W3110S.gb/5839‑5900                                                 |              gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:12322/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:84325/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:79514/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:77177/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:73233/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:72947/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:72588/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:71292/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:71033/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:66205/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:6458/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:636/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:62920/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:62697/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:61278/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:51188/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:48641/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:47584/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:42091/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:32152/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:31583/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:30785/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:30546/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:24395/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:13194/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:12955/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtct  >  1:11106/1‑62 (MQ=255) gTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGTTTGATAAtc   >  1:86816/1‑61 (MQ=255)                                                 |              GTAGAAGCTGATGATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCT  >  W3110S.gb/5839‑5900

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑