Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	2,866,888	A→T	T174T (ACT→ACA)	nlpD ←	predicted outer membrane lipoprotein

Read alignment evidence...
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*	W3110S.gb	2,866,888	0	A	T	100.0%	166.9 / NA	92	T174T (ACT→ACA)	nlpD	predicted outer membrane lipoprotein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/92);  total (0/92)

CTGCGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCAGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCA  >  W3110S.gb/2866857‑2866916                                |                             ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:50207/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:56600/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:56128/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:54755/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:54443/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:53596/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:53399/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:52968/60‑1 (MQ=255) ctgcGTCGGCCTGGGTAATGGCATTTCCGCCTGTGATTGGCGTACCGGAAGCATTACCCa  <  1:52569/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑