Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,941,607 A→G T65T (ACT→ACC)  ygdI ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,941,6070AG99.1% 207.8 / NA 107T65T (ACT→ACC) ygdIhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (0/106);  minor base T (0/1);  total (0/107)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

GATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGT  >  W3110S.gb/2941565‑2941625
                                          |                  
taTCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:83524/60‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCTGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:27205/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCTGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:5621/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTTCGGTTGATCTGCtgt  <  1:85338/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:57774/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:68625/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:68221/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:67714/61‑1 (MQ=255)
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gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:66374/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:66060/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:64138/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:64021/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:62506/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:60154/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:58570/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:71364/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:57563/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:57332/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:56216/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:55980/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:10216/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:55910/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:54307/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:53415/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:76262/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:88499/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:8784/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:87496/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:86881/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:86545/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:85666/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:84662/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:82153/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:80432/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:76370/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:69176/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:76163/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:75383/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:75031/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:73169/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:73135/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:72940/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:72578/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:72038/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:55915/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:70956/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:22460/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:33272/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:31725/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:49261/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:28828/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:28270/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:2750/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:26632/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:26478/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:2631/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:24113/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:23371/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:29014/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:21207/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:20134/61‑1 (MQ=255)
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gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:16781/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:1374/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:13575/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:1290/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:1263/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:10621/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:10257/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:41086/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:4918/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:48389/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:46997/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:463/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:45585/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:44756/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:4338/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:42397/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:40860/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:40666/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:39202/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:36426/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:38155/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:38514/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:38647/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTAGATCTGCtgt  <  1:57383/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGCACGGTTGATCTGCtgt  <  1:73898/61‑1 (MQ=255)
gATCGCGAACTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:68024/61‑1 (MQ=255)
 aTCGCGAATTACTGATCGAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:20121/60‑1 (MQ=255)
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 aTCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:35387/60‑1 (MQ=255)
 aTCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:2266/60‑1 (MQ=255)
 aTCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:67854/60‑1 (MQ=255)
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        aTTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:80485/53‑1 (MQ=255)
         ttACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:26931/52‑1 (MQ=255)
         ttACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCGGTACGGTTGATCTGCtgt  <  1:61056/52‑1 (MQ=255)
                                          |                  
GATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGT  >  W3110S.gb/2941565‑2941625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑