Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,980,254	T→C	V195V (GTA→GTG)	araE ←	arabinose transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,980,254	0	T	C	98.0%	89.7 / ‑5.2	49	V195V (GTA→GTG)	araE	arabinose transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (48/0);  minor base G (1/0);  total (49/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01

CTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACTACCAGA  >  W3110S.gb/2980200‑2980260                                                       |       cTCAATATGCCGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:24319/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACGACCAGa  >  1:3620/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAg   >  1:56569/1‑60 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAg   >  1:26831/1‑60 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:6340/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:51783/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:53188/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:53898/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:55503/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:58048/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:5921/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:5947/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:62408/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:62464/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:63081/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:11318/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:64596/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:65934/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:72125/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:72358/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:7520/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:78956/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:79138/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:80178/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:80874/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:83876/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:48719/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:10773/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:11862/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:11970/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:13317/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:1412/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:14944/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:285/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:29899/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:30577/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:30944/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:31392/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:31645/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:34235/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:38895/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:38996/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:39569/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:41962/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:42029/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:46140/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:46144/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:50124/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGACGCCACTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACCACCAGa  >  1:85698/1‑61 (MQ=255)                                                       |       CTCAATATGACGCCCCTTTTCCGCCAGCCAGCGCGGGCTATTTGGCAGGAAGACTACCAGA  >  W3110S.gb/2980200‑2980260

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑