Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,982,727	T→C	Q18Q (CAA→CAG)	kduI ←	predicted 5‑keto 4‑deoxyuronate isomerase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,982,727	0	T	C	100.0%	111.9 / NA	58	Q18Q (CAA→CAG)	kduI	predicted 5‑keto 4‑deoxyuronate isomerase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (58/0);  total (58/0)

TGCGCAGCCCTTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTC  >  W3110S.gb/2982717‑2982777           |                                                   tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACtg                      >  1:16164/1‑41 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGt   >  1:50689/1‑60 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGt   >  1:41471/1‑60 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGt   >  1:38566/1‑60 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:65858/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:45754/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:49897/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:51400/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:5458/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:55055/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:55693/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:57847/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:60095/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:60532/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:61339/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:64869/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:4380/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:70851/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:73542/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:73888/1‑61 (MQ=255) 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tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:32889/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:33116/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:45257/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:35230/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:37216/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:3811/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:38344/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:40379/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:41137/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:41534/1‑61 (MQ=255) tGCGCAGCCCCTGGGTATCCAGCGTTTTTGCGTGCGCACTGTGGATGCTCTGTCTTACGTc  >  1:42622/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑