Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,167,588 G→A A100A (GCC→GCT)  ygiV ← predicted transcriptional regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,167,5880GA100.0% 203.0 / NA 112A100A (GCC→GCT) ygiVpredicted transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (112/0);  total (112/0)

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

GTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTAT  >  W3110S.gb/3167576‑3167637
            |                                                 
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCCCCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:80465/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTc                  >  1:46494/2‑46 (MQ=19)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGcc             >  1:64844/2‑51 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAAc        >  1:45826/2‑56 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:64415/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:68763/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:68706/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:68018/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:67490/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:67306/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:67093/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:65299/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:64764/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:64707/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:64592/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:7233/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:62973/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:81720/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:78901/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:78235/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:31759/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:31615/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:30202/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:29274/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:28921/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:28202/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:26740/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:25978/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:24066/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:20441/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:19352/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:1775/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:14356/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:14295/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:13155/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:13104/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:1254/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:11992/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:11660/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:11578/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:11519/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:10853/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:41186/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:10679/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:49590/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:48972/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:48090/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:47897/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:42797/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:40906/2‑62 (MQ=255)
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atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:35670/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:3544/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:34906/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:34767/2‑62 (MQ=255)
atGGCGGGCAACAGCATAACGCCCACCGGTAAGTTCGCCATTACTCACGCCATAACGATTAt  >  1:3388/2‑62 (MQ=255)
            |                                                 
GTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTAT  >  W3110S.gb/3167576‑3167637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑