Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,175,370 C→T E40E (GAG→GAA)  cpdA ← cyclic 3',5'‑adenosine monophosphate phosphodiesterase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,175,3700CT100.0% 63.6 / NA 36E40E (GAG→GAA) cpdAcyclic 3',5'‑adenosine monophosphate phosphodiesterase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (36/0);  total (36/0)

CCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAG  >  W3110S.gb/3175357‑3175417
             |                                               
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAggg                        >  1:9188/1‑39 (MQ=37)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCttt             >  1:72885/1‑50 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCTAACAg  >  1:18903/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:72375/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:69587/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:73859/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:76253/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:78620/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:78721/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:79379/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:79587/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:79883/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:79970/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:80040/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:81312/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:82060/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:84820/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:86196/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:88583/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:38562/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:15861/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:20690/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:26464/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:27674/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:30246/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:31367/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:36144/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:3850/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:13494/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:42263/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:44694/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:48915/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:48924/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:51023/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:53030/1‑61 (MQ=255)
ccGCCTGGTAGCTTTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAg  >  1:56985/1‑61 (MQ=255)
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CCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAG  >  W3110S.gb/3175357‑3175417

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑