Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,402,441	C→T	Q249Q (CAG→CAA)	yhdA ←	conserved inner membrane protein

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,402,441	0	C	T	100.0%	152.0 / NA	81	Q249Q (CAG→CAA)	yhdA	conserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (81/0);  total (81/0)

CATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAT  >  W3110S.gb/3402408‑3402469                                  |                             catcatcaCGATCCCGTGTGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:19066/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCCACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:42073/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAGCGTTGCTAACTGAt  >  1:1226/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAAc               >  1:67402/1‑49 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTg    >  1:10131/1‑60 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGag  >  1:61291/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGa   >  1:54748/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGa   >  1:85930/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGa   >  1:31329/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGa   >  1:77980/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGa   >  1:27904/1‑61 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:64062/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:53830/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:66911/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:66798/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:65885/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:65022/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:64372/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:9751/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:59624/1‑62 (MQ=255) 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catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:43848/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:43095/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:41313/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:40858/1‑62 (MQ=255) catcatcaCGATCCCGTGGGTACAAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:44638/1‑62 (MQ=255) cataatcaCGATCCCGTGGGTACCAACTTTCTCTTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAt  >  1:9670/1‑62 (MQ=255)                                  |                             CATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAACTGAT  >  W3110S.gb/3402408‑3402469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑