Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,402,833 A→G L119L (TTG→CTG)  yhdA ← conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,402,8330AG100.0% 133.5 / NA 69L119L (TTG→CTG) yhdAconserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/69);  total (0/69)

TGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAACGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACG  >  W3110S.gb/3402803‑3402864
                              |                               
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:70512/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:67136/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:58731/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:58155/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:70801/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:52223/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:71947/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:11563/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:35044/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:3570/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:42086/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:36653/62‑1 (MQ=255)
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tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:3722/62‑1 (MQ=255)
tGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:37339/62‑1 (MQ=255)
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 tcccATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:5632/60‑1 (MQ=255)
 gCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACTTCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:39967/61‑1 (MQ=255)
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 gCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:52119/61‑1 (MQ=255)
 gCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:52508/61‑1 (MQ=255)
 gCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:5406/61‑1 (MQ=255)
 gCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:60081/61‑1 (MQ=255)
          aTCCTGATAAACCAGACGCAGCGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACg  <  1:56457/52‑1 (MQ=255)
                              |                               
TGCCCATCGGATCCTGATAAACCAGACGCAACGACATCCCCGGATGCTTTATCAACGGAACG  >  W3110S.gb/3402803‑3402864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: