Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,452,110 G→A I1109I (ATC→ATT)  rpoB ← RNA polymerase, beta subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,452,1100GA100.0% 116.6 / NA 65I1109I (ATC→ATT) rpoBRNA polymerase, beta subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (65/0);  total (65/0)

GGATCTGACCGATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCGG  >  W3110S.gb/3452100‑3452160
          |                                                  
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCGAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:88039/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCa                           >  1:2087/1‑36 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTc        >  1:32918/1‑55 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCt       >  1:54005/1‑56 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:7067/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:48417/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:69834/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:68823/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:63241/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:61770/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:60189/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:5505/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:54125/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:53831/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:53401/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:52984/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:50710/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:4781/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:7095/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:71051/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:73750/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:7736/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:77381/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:80879/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:8135/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:82145/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:8221/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:83344/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:83901/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:83959/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:85533/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:86624/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:87230/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:29695/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:11003/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:11076/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:12147/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:12982/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:16685/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:17746/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:19292/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:19640/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:19775/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:21064/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:23025/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:25467/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:27027/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:2960/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:48359/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:3031/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:31170/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:31261/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:32371/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:33891/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:36356/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:36679/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:38536/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:3989/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:43338/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:44350/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:45700/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:10641/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTATACCgg  >  1:42244/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTAAGATGTCTACCgg  >  1:26096/1‑61 (MQ=255)
ggATCTGACCAATGATCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCgg  >  1:66886/1‑61 (MQ=255)
          |                                                  
GGATCTGACCGATGTTCATACGAGACGGTACGCCCAGCGGGTTCAGTACGATGTCTACCGG  >  W3110S.gb/3452100‑3452160

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑