Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,474,704 G→A A69A (GCC→GCT)  yijD ← conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,474,7040GA100.0% 256.2 / NA 139A69A (GCC→GCT) yijDconserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (139/0);  total (139/0)

Only 100 of 139 total aligned reads displayed.

AGAATAAAACAGGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACG  >  W3110S.gb/3474693‑3474754
           |                                                  
agaATAAAACAAGCTGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:16703/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGCCCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGAGAAc   >  1:50263/1‑61 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGAGCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:23559/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATaa    >  1:62293/1‑60 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATa     >  1:88245/1‑59 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAAc   >  1:41420/1‑61 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAAc   >  1:20718/1‑61 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAAc   >  1:56610/1‑61 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAAc   >  1:28320/1‑61 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:57783/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:64457/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:62753/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:87967/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:61298/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:60796/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:60738/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:59963/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:59785/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:59222/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:59082/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:65705/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:55176/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:54873/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:54171/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:54162/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:52869/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:52765/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:52022/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:50390/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:48917/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:74889/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:85199/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:84525/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:81180/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:80464/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:78779/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:76240/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:76222/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:75253/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:75128/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:86902/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:74972/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:65351/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:74867/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:72855/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:71984/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:71630/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:69325/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:6878/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:67357/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:66722/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:66257/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:85513/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:20361/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:49276/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:32334/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:31286/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:30734/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:28957/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:28733/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:28695/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:26392/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:23668/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:21194/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:20605/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:3240/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:20327/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:19949/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:1988/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:19300/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:18798/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:18361/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:18017/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:14380/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:12794/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:11166/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:42414/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:11049/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:48782/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:47797/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:47580/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:47332/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:46841/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:46761/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:45421/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:45416/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:43250/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:33550/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:42271/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:41765/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:39366/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:38484/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:37742/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:36613/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:3605/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:34674/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:34258/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTCCGATTAAGATAACg  >  1:41722/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACAGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:25843/1‑62 (MQ=255)
agaATAAAACAAGCAGCTGACAGACACGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACg  >  1:82097/1‑62 (MQ=255)
           |                                                  
AGAATAAAACAGGCAGCTGCCAGACCCGGCAAGCCTACCGGCATAGTGCGATTAAGATAACG  >  W3110S.gb/3474693‑3474754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑