Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,574,402	A→G	S11S (AGT→AGC)	yihN ←	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,574,402	0	A	G	95.2%	32.6 / ‑5.1	21	S11S (AGT→AGC)	yihN	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (20/0);  minor base T (1/0);  total (21/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01

CGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTT  >  W3110S.gb/3574363‑3574424                                        |                       cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCCCACAGTGTTAATAGGCt                      >  1:4591/1‑42 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGTCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:37521/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:49919/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:9917/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:81852/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:81367/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:80391/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:7566/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:74654/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:6159/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:60810/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:54494/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:50910/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:10763/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:41464/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:40475/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:27725/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:26713/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:26249/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:22819/1‑62 (MQ=255) cGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGGCTAAATAACGCCCATTTCtttt  >  1:15767/1‑62 (MQ=255)                                        |                       CGGTAATTTATAAATTGTACCGCCACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTT  >  W3110S.gb/3574363‑3574424

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑