Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	17,451	A→C	intergenic (‑491/‑38)	mokC ← / → nhaA	regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter

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*	W3110S.gb	17,451	0	A	C	100.0%	120.6 / NA	65	intergenic (‑491/‑38)	mokC/nhaA	regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (0/65);  total (0/65)

ATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACG  >  W3110S.gb/17399‑17460                                                     |          gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGTTTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:59649/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGTGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:25648/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:70696/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:1043/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:61169/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:61987/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:63100/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:63325/60‑1 (MQ=255) gctattCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATCGTGAAAACg  <  1:6396/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑