Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,854,822	C→T	A112A (GCG→GCA)	gpmI ←	phosphoglycero mutase III, cofactor‑independent

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,854,822	0	C	T	100.0%	82.5 / NA	46	A112A (GCG→GCA)	gpmI	phosphoglycero mutase III, cofactor‑independent
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (46/0);  total (46/0)

GCAGACCCATAATGTGTACCGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCT  >  W3110S.gb/3854803‑3854849                    |                            gCAGCCCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:4025/1‑47 (MQ=39) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:69339/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:10238/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:42721/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:46391/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:48977/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:53285/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:58585/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:60229/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:63946/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:64082/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:66166/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:42354/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:70087/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:71829/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:73799/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:75984/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:78022/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:83874/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:84648/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:86287/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:8754/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:8977/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:22867/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:10287/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:10837/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:11030/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:12570/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:13519/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:17242/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:17258/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:17855/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:19004/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:19602/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:422/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:28062/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:31182/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:31709/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:34048/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:34705/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:37550/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:39008/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:40964/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:4123/1‑47 (MQ=255) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTTTGCCTGCGTTTTGCGCTTTATCt  >  1:48021/1‑47 (MQ=39) gCAGACCCATAATGTGTACTGCTATGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCt  >  1:86443/1‑47 (MQ=39)                    |                            GCAGACCCATAATGTGTACCGCTTTGCCTGCGTTTTTCGCTTTATCT  >  W3110S.gb/3854803‑3854849

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑