Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,960,176	G→A	L275L (CTG→TTG)	kdgK ←	ketodeoxygluconokinase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,960,176	0	G	A	100.0%	32.8 / NA	21	L275L (CTG→TTG)	kdgK	ketodeoxygluconokinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (21/0);  total (21/0)

GCCTGTCAGACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCG  >  W3110S.gb/3960168‑3960228         |                                                     gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:41147/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:86019/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:80297/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:73780/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:71443/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:60647/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:58053/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:57558/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:54422/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:54319/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:5253/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:10023/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:34853/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:34208/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:32007/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:31288/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:30951/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:30249/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:3007/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:23932/1‑61 (MQ=255) gccCGTCAAACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCg  >  1:12327/1‑61 (MQ=255)         |                                                     GCCTGTCAGACGTACCGCCAGATAACCGGCACTGAAAGAGTCGCCAGCTGCGGTGGTATCG  >  W3110S.gb/3960168‑3960228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑