Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 416,923 T→C T186T (ACT→ACC)  phoB → DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoR (or CreC)

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb416,9230TC100.0% 184.2 / NA 98T186T (ACT→ACC) phoBDNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoR (or CreC)
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/98);  total (0/98)

TGGGGAACTAACGTGTATGTGGAAGACCGCACGGTCGATGTCCACATTCGTCG  >  W3110S.gb/416915‑416967
        |                                            
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TGGGGAACTAACGTGTATGTGGAAGACCGCACGGTCGATGTCCACATTCGTCG  >  W3110S.gb/416915‑416967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑