Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,012,726	G→A	P616P (CCG→CCA)	rbbA →	fused ribosome‑associated ATPases

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,012,726	0	G	A	100.0%	85.7 / NA	47	P616P (CCG→CCA)	rbbA	fused ribosome‑associated ATPases
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/47);  total (0/47)

CGTTACTTTATCGAACAGCCGCCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGATGCGTG  >  W3110S.gb/4012706‑4012766                     |                                         ctttACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:56483/59‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:72437/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:57002/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:57277/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:58471/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:59221/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:59324/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:60408/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:61828/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:62415/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:68341/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:72196/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:51370/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:73390/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:75413/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:76620/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:80382/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:80407/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:80608/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:81717/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:81935/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:85418/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:86247/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:3597/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:1617/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:19661/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:21107/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:23212/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:24470/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:24783/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:32277/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:33800/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:34702/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:15970/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:36860/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:40147/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:42233/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:42786/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:42847/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:45608/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:46428/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:47850/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:48778/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:49751/61‑1 (MQ=255) cGTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGGTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:24693/61‑1 (MQ=255)  gTTACTTTATCGAACAGCTACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:78719/60‑1 (MQ=255)  gTTACTTTATCGAACAGCCACCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGAtgcgtg  <  1:39261/60‑1 (MQ=255)                     |                                         CGTTACTTTATCGAACAGCCGCCGCTCACCAGTTATGACGAGCTTGATCGTCGGATGCGTG  >  W3110S.gb/4012706‑4012766

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑