Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,021,928	C→A	E238D (GAG→GAT)	nikE ←	nickel transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,021,928	0	C	A	100.0%	108.4 / NA	61	E238D (GAG→GAT)	nikE	nickel transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (61/0);  total (61/0)

TAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCA  >  W3110S.gb/4021877‑4021938                                                    |           tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGTAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:52013/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccaccc  >  1:69980/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:70632/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:54550/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:56352/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:56856/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:61350/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:61811/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:62730/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:64459/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:64650/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:6484/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:65049/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:65403/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:18136/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:75111/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:75246/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:75349/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:77050/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:78880/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:79320/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:82878/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:83769/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:84254/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:86550/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:86745/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:86977/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:37239/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:31823/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:32217/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:31120/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:32747/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:33694/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:34128/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:29890/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:3513/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:20299/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:20195/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:36767/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:41892/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:46095/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:466/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:47413/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:47545/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:1992/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:10915/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:54441/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:50166/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:50711/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:51887/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:9111/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:78573/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:73713/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:67522/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:47824/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacc   >  1:57718/1‑61 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacaa  >  1:28940/1‑60 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccac    >  1:75817/1‑60 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccac    >  1:35477/1‑60 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTAGCTCccacca  >  1:80600/1‑62 (MQ=255) tAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGAGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTATCTCccacca  >  1:61209/1‑62 (MQ=255)                                                    |           TAATACCGCGTTTTGTAGCACACGTCCGGCGTCAGAGGAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCA  >  W3110S.gb/4021877‑4021938

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑