Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,027,997 A→G L186L (TTA→CTA)  yhhT ← predicted inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,027,9970AG98.9% 179.4 / ‑6.1 92L186L (TTA→CTA) yhhTpredicted inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (0/91);  minor base C (0/1);  total (0/92)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

TAGCGTCTTCAATGCAAGATAGTGCGAAACGCCTTTAAGTGCGCGGTGTAATCCCGCGATG  >  W3110S.gb/4027947‑4028007
                                                  |          
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 aGCGTCTTTAACGCCAGATAATGCGAAACGCCTTTAAGTGCGCGGTGTAGTCCGGCGAtg  <  1:33655/60‑1 (MQ=255)
     tCTTTAACGCCAGATAATGCGAAACGCCTTTAAGTGCGCGGTGTAGTCCGGCGAtg  <  1:23814/56‑1 (MQ=255)
                                                  |          
TAGCGTCTTCAATGCAAGATAGTGCGAAACGCCTTTAAGTGCGCGGTGTAATCCCGCGATG  >  W3110S.gb/4027947‑4028007

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑