Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,078,042	A→G	T121T (ACT→ACC)	glpD ←	sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,078,042	0	A	G	100.0%	40.3 / NA	24	T121T (ACT→ACC)	glpD	sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (24/0);  total (24/0)

TTCCGGTTTTAACACTGAATTTGCGCCAAAACGCAAACCAGTTGATCCCGGCAAGCTGGTGC  >  W3110S.gb/4078003‑4078064                                        |                       ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGtt                     >  1:5670/1‑43 (MQ=38) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:57041/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:87590/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:8640/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:83837/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:7847/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:76956/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:70808/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:67984/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:67032/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:65951/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:61947/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:59224/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:10490/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:35851/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:35019/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:3314/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:30029/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:29585/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:27289/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:22185/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:18122/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:1631/1‑62 (MQ=255) ttCCGGTTTTAACACTGAGTTTGCGCCAAAACGCAAACCGGTTGATCCCGGCAGGCTGGTGc  >  1:12330/1‑62 (MQ=255)                                        |                       TTCCGGTTTTAACACTGAATTTGCGCCAAAACGCAAACCAGTTGATCCCGGCAAGCTGGTGC  >  W3110S.gb/4078003‑4078064

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑