Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,142,993	G→A	V141V (GTC→GTT)	nirC ←	nitrite transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,142,993	0	G	A	100.0%	145.4 / NA	80	V141V (GTC→GTT)	nirC	nitrite transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (80/0);  total (80/0)

TTGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGC  >  W3110S.gb/4142965‑4143026                             |                                  ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGa                          >  1:72680/1‑38 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGa                      >  1:33101/1‑42 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATc            >  1:57489/1‑52 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTAc         >  1:65405/1‑55 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCgg      >  1:45342/1‑58 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCgg      >  1:14540/1‑58 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGgcagc  >  1:54328/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGgcagc  >  1:6183/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCAACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGgcagc  >  1:6144/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑