Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,151,419	A→T	Q394H (CAA→CAT)	argD →	bifunctional acetylornithine aminotransferase and succinyldiaminopimelate aminotransferase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,151,419	0	A	T	97.7%	77.8 / ‑5.8	44	Q394H (CAA→CAT)	argD	bifunctional acetylornithine aminotransferase and succinyldiaminopimelate aminotransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base T (43/0);  minor base G (1/0);  total (44/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

CGATGAAGGGATGCAACGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGT  >  W3110S.gb/4151404‑4151456                |                                      cGATGAAGGGATGCGTCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:3444/1‑53 (MQ=39) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGa                 >  1:34909/1‑38 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAggtggt          >  1:53341/1‑45 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:60262/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:428/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:50577/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:5101/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:53114/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:56936/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:58591/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:59756/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:41382/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:63943/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:73997/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:74060/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:74712/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:77199/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:82925/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:84017/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:84801/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:86990/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:8752/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:40145/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:12281/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:12748/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:13823/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:14398/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:14560/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:14702/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:18063/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:18944/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:19771/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:20279/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:206/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:27660/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:30502/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:31546/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:36082/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:39063/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:3913/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:11803/1‑53 (MQ=255) cGATGAAGGGATGCATCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGCGCGt  >  1:47932/1‑53 (MQ=39) cGATGAAGGGATGCATCGATTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGc    >  1:62665/1‑51 (MQ=38) cGATGAAGGGATGCAGCGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGt  >  1:21222/1‑53 (MQ=255)                |                                      CGATGAAGGGATGCAACGTTTCGCCCACGCGGTGGCGAAGGTGGTTGGGGCGT  >  W3110S.gb/4151404‑4151456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑