Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,164,040 C→T F21F (TTC→TTT yheO → predicted DNA‑binding transcriptional regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,164,0400CT100.0% 61.1 / NA 36F21F (TTC→TTTyheOpredicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/36);  total (0/36)

GCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCA  >  W3110S.gb/4163989‑4164045
                                                   |     
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:60491/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:39463/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:39961/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:40437/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:46762/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:49913/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:56786/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:59159/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:59285/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:38315/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:6157/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:68369/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:68872/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:73095/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:77080/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:81053/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:85316/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:85427/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:27124/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:18607/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:2090/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:21237/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:24288/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:26072/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:26789/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:27009/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:1478/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:27559/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:27940/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:34024/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:35213/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:35432/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:3641/57‑1 (MQ=255)
gCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:37795/57‑1 (MQ=255)
  ttttAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:3393/55‑1 (MQ=255)
                 ccAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTTGACCa  <  1:24457/40‑1 (MQ=255)
                                                   |     
GCTTTTAACCAACGAAACCAGTGAGTTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCA  >  W3110S.gb/4163989‑4164045

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: