Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,184,217	T→A	P208P (CCA→CCT)	gspC ←	general secretory pathway component, cryptic

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,184,217	0	T	A	100.0%	80.7 / NA	46	P208P (CCA→CCT)	gspC	general secretory pathway component, cryptic
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (46/0);  total (46/0)

GATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCTGGTTGTAGCAAGCTGGTGGTAAATGCA  >  W3110S.gb/4184189‑4184244                             |                            gATTATTGATCCTGAGGTCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:81999/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCtgg             >  1:32804/1‑45 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAATTGCa  >  1:26681/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGc   >  1:5168/1‑55 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGc   >  1:46424/1‑55 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:69504/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:55186/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:57048/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:58270/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:59110/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:66343/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:67022/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:68718/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:68973/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:69139/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:9875/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:71623/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:7773/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:78858/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:81969/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:83914/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:8475/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:85732/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:86500/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:10458/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:29737/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:12523/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:13305/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:13529/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:13953/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:15190/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:17334/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:17807/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:21584/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:26644/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:55066/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:30186/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:37611/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:38981/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:40185/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:45510/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:49096/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:51025/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:5153/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:54931/1‑56 (MQ=255) gATTATTGATCCTAAGGGCGATATCCCCAGGTTGCAGCAAGCTGGTGGTAAATGCa  >  1:23093/1‑56 (MQ=255)                             |                            GATTATTGATCCTGAGGGCGATATCCCCTGGTTGTAGCAAGCTGGTGGTAAATGCA  >  W3110S.gb/4184189‑4184244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑