Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,201,257	G→A	D117N (GAC→AAC)	yhdN →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,201,257	0	G	A	100.0%	67.6 / NA	38	D117N (GAC→AAC)	yhdN	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/38);  total (0/38)

GTTGGACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCAAAA  >  W3110S.gb/4201253‑4201314     |                                                          gttgAACAAAATCAACTATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:21534/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:70625/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:55306/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:56547/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:57329/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:59486/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:60040/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:60086/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:61800/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:66987/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:69122/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:13380/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:75690/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:81319/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:81342/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:84874/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:85239/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:8585/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:86275/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:46961/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:10737/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:19085/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:23367/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:27721/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:28260/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:28954/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:29192/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:30843/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:32782/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:36738/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:38456/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:38580/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:38968/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:41257/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:41947/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:44921/62‑1 (MQ=255) gttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:55271/62‑1 (MQ=255)  ttgAACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCaaaa  <  1:87892/61‑1 (MQ=255)     |                                                          GTTGGACAAAATCAACGATAACTAGTGGAGTATGTATGTATCGCATTGGTGAGCTGGCAAAA  >  W3110S.gb/4201253‑4201314

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑