Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,335,388 T→C L69L (CTT→CTC)  proP → proline/glycine betaine transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,335,3880TC100.0% 199.1 / NA 105L69L (CTT→CTC) proPproline/glycine betaine transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/105);  total (0/105)

Only 100 of 105 total aligned reads displayed.

CTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAC  >  W3110S.gb/4335357‑4335419
                               |                               
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  gACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTCGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAc  <  1:63231/61‑1 (MQ=255)
     cccAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTCGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAc  <  1:45641/58‑1 (MQ=255)
       cAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTCGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAc  <  1:74374/56‑1 (MQ=255)
            tGCAGATGGTTGCTGCACTCGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAc  <  1:84467/51‑1 (MQ=255)
             gCAGATGGTTGCTGCACTCGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAc  <  1:40549/50‑1 (MQ=255)
                               |                               
CTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGAC  >  W3110S.gb/4335357‑4335419

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑