Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,429,264 G→A H70H (CAC→CAT)  yjfY ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,429,2640GA100.0% 193.7 / NA 103H70H (CAC→CAT) yjfYhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/103);  total (0/103)

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

CGTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCC  >  W3110S.gb/4429221‑4429281
                                           |                 
cGTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCACGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:54885/61‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:68498/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:68480/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:68280/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:67523/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:6746/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:66562/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:66292/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:64875/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:64325/60‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:60206/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:6882/60‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:19874/60‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:16205/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:1566/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:15613/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:1353/60‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:10064/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:36721/60‑1 (MQ=255)
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 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:27997/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAAAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:5039/60‑1 (MQ=255)
 gTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAAAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:24911/60‑1 (MQ=255)
  tGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:87026/59‑1 (MQ=255)
  tGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:71744/59‑1 (MQ=255)
                       ggTGCCCGCATCAGAATCACATGGTAGTACGTTGCGcc  <  1:6128/38‑1 (MQ=25)
                                           |                 
CGTGCATATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCC  >  W3110S.gb/4429221‑4429281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑