Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,600,207	C→A	T109T (ACG→ACT)	yjjM ←	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,600,207	0	C	A	100.0%	59.7 / NA	34	T109T (ACG→ACT)	yjjM	predicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/34);  total (0/34)

CAGAAAACGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTATCA  >  W3110S.gb/4600200‑4600241        |                                   cAGAAAAAGTTTCTCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:44300/42‑1 (MQ=37) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:62847/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:55984/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:57187/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:57246/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:57804/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:60588/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:61275/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:62735/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:55493/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:65442/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:65552/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:67191/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:71706/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:72035/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:7336/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:74707/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:86289/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:11029/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:53967/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:47872/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:45578/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:38/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:33899/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:33491/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:3041/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:29882/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:25110/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:21394/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:1388/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:12456/42‑1 (MQ=255) cAGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:12253/42‑1 (MQ=255)  aGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:49275/41‑1 (MQ=255)  aGAAAAAGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTatca  <  1:29365/41‑1 (MQ=255)        |                                   CAGAAAACGTTTCCCCTGGGCGTAACTGGCGCTGGTTTATCA  >  W3110S.gb/4600200‑4600241

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑