Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	458,543	G→A	L144L (CTG→CTA)	lon →	DNA‑binding ATP‑dependent protease La

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	458,543	0	G	A	97.0%	52.3 / ‑2.8	33	coding (432/2355 nt)	lon	DNA‑binding ATP‑dependent protease La
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (32/0);  minor base . (1/0);  total (33/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01

AACAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTGAACAA  >  W3110S.gb/458488‑458548                                                        |      aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:68328/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:4945/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:51644/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:54707/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:55671/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:56943/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:60371/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:62671/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:67421/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:48175/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:69051/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:75185/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:76055/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:83881/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:84846/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:85871/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:86848/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:1090/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:45904/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:450/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:4493/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:38018/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:36169/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:32666/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:32366/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:2790/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:27797/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:17365/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:16837/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:14849/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACaa  >  1:10900/1‑61 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTAAACa   >  1:2274/1‑60 (MQ=255) aaCAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCT‑AACaa  >  1:37527/1‑60 (MQ=255)                                                        |      AACAGGAAGTGCTGGTGCGTACTGCAATCAGCCAGTTCGAAGGCTACATCAAGCTGAACAA  >  W3110S.gb/458488‑458548

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑