Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	488,261	C→T	G834G (GGC→GGT)	kefA →	fused mechanosensitive channel proteins

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	488,261	0	C	T	100.0%	75.6 / NA	45	G834G (GGC→GGT)	kefA	fused mechanosensitive channel proteins
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/45);  total (0/45)

GGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAT  >  W3110S.gb/488247‑488308               |                                                gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAATAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:88552/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:72550/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:4697/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:48533/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:54558/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:55744/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:56975/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:57552/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:6094/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:65016/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:6549/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:66945/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:70835/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:46825/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:7287/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:72969/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:76547/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:77196/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:77737/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:82847/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:83340/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:86860/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:94/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:30006/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:11884/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:12678/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:12764/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:13364/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:14098/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:18746/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:21727/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:28591/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:29411/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:29687/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:11545/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:30653/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:33722/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:34339/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:37471/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:37636/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:39080/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:39750/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:40034/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:42396/59‑1 (MQ=255) gctaCTGAAGCTGGTGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAt  <  1:46498/59‑1 (MQ=255)               |                                                GGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGAT  >  W3110S.gb/488247‑488308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑