Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	602,570	2 bp→CG	intergenic (+12/+68)	pheP → / ← ybdG	phenylalanine transporter/predicted mechanosensitive channel

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	602,570	0	T	C	100.0%	146.1 / NA	78	intergenic (+12/+69)	pheP/ybdG	phenylalanine transporter/predicted mechanosensitive channel
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/78);  total (0/78)
*	W3110S.gb	602,571	0	A	G	100.0%	150.7 / NA	78	intergenic (+13/+68)	pheP/ybdG	phenylalanine transporter/predicted mechanosensitive channel
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/78);  total (0/78)

TCACGCTACATCCGACAAAACGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATCC  >  W3110S.gb/602564‑602614       ||                                            tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:69221/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:8051/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:78961/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:78023/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:76885/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:74779/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:73422/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:71720/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:71627/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:70776/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:8052/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:68911/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:66639/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:66440/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:64936/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:62236/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:60130/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:58509/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:57554/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:1194/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:84479/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:9241/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:9230/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:8939/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:88647/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:87926/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:87225/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:8638/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:85872/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:84588/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:56902/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:84427/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:84120/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:84103/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:83258/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:81684/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:81383/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:81225/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:80857/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:2373/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:27748/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:26904/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:26552/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:26091/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:26062/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:25927/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:24623/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:24360/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:24296/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:2962/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:2339/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:2127/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:21181/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:18707/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:15823/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:15125/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:14670/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:13632/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:42582/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:54741/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:54482/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:49122/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:4465/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:44522/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:44292/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:13441/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:43550/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:42440/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:41730/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:38367/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:37081/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:33747/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:31936/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:30324/51‑1 (MQ=37) tCACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:29637/51‑1 (MQ=37)  cACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:12093/50‑1 (MQ=37)  cACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:43991/50‑1 (MQ=37)  cACGCCGCATCCGACAAAATGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATcc  <  1:57471/50‑1 (MQ=37)       ||                                            TCACGCTACATCCGACAAAACGATGTCAACCATCCGAAACCGCTCTCATCC  >  W3110S.gb/602564‑602614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑