Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 331,219 | 2 bp→TT | intergenic (+499/‑375) | betT → / → yahA | choline transporter of high affinity/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 331,219 | 0 | G | T | 100.0% | 118.4 / NA | 70 | intergenic (+499/‑376) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (0/70); total (0/70) | |||||||||||
* | W3110S.gb | 331,220 | 0 | A | T | 100.0% | 124.8 / NA | 70 | intergenic (+500/‑375) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (0/70); total (0/70) |
GACGCTATGTGTTTATGAGGGAGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCATATA > W3110S.gb/331199‑331259 || gACTCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:75794/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:61340/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:74620/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:74551/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:71434/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:6946/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:68384/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:68089/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:66558/61‑1 (MQ=255) gACGCTATGTGTTTATGAGGTTGAGGTATTTTCAGTTGATCTGGATTGTTAAATTCAtata < 1:75738/61‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |