Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,386,660 2 bp→AC coding (1383‑1384/1968 nt) aaeB ← p‑hydroxybenzoic acid efflux system component

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,386,6600GA98.7% 121.6 / NA 74L462L (CTG→TTG) aaeBp‑hydroxybenzoic acid efflux system component
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (73/0);  minor base C (1/0);  total (74/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00
*W3110S.gb3,386,6610TC98.7% 142.0 / ‑5.7 74A461A (GCA→GCG) aaeBp‑hydroxybenzoic acid efflux system component
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (73/0);  minor base A (1/0);  total (74/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01

ATAATATTTATGGTGCTGGCCAGTGCCCCCATCGAGCCCAGTCGCCGTTTCTGTACTTCTATA  >  W3110S.gb/3386638‑3386700
                      ||                                       
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ataatgTTTATGGTGCTGGCCAACGCCCCCATCGa                              >  1:63863/1‑35 (MQ=21)
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ataatgTTTATGGTGCTGGCCAACGCCCCCATCGAGCCCAATCTCCGTTTCTGTACTTCtat   >  1:19692/1‑62 (MQ=255)
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ataatgTTTATGGTGCTGGCCAACGCCCCCATCGAGCCCAATCTCCGTTTCTGTACTTCtat   >  1:14530/1‑62 (MQ=255)
ataatgTTTATGGTGCTGGCCAACGCCCCCATCGAGCCCAATCTCCGTTTCTGTACTTCtat   >  1:12921/1‑62 (MQ=255)
ataatgTTTATGGTGCTGGCCAACGCCCCCATCGAGCCCAATCTCCGTTTCTGTACTTCtat   >  1:10303/1‑62 (MQ=255)
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                      ||                                       
ATAATATTTATGGTGCTGGCCAGTGCCCCCATCGAGCCCAGTCGCCGTTTCTGTACTTCTATA  >  W3110S.gb/3386638‑3386700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑