Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,878,701	C→T	P27S (CCG→TCG)	yeaO →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,878,701	0	C	T	100.0%	135.8 / NA	42	P27S (CCG→TCG)	yeaO	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (19/23);  total (19/23)

CGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGCCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGAA  >  W3110S.gb/1878654‑1878751                                                |                                                   ctgCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:837207/3‑61 (MQ=255) cGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:110500/1‑61 (MQ=255) cGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:1274349/1‑61 (MQ=255) cGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:4053161/1‑61 (MQ=255) cGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:1957572/1‑61 (MQ=255) cGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCaa                                       >  1:714568/1‑61 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:1029504/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:3668118/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:3105605/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:4066526/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:1752448/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:4667007/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:1528775/62‑1 (MQ=255)            agCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGAttt                           <  1:1448376/62‑1 (MQ=255)             gCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTa                          >  1:2587656/1‑62 (MQ=255)             gCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTa                          >  1:2662351/1‑62 (MQ=255)                 tGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:533849/62‑1 (MQ=255)                 tGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:1464240/62‑1 (MQ=255)                 tGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:2909874/62‑1 (MQ=255)                 tGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:791521/62‑1 (MQ=255)                 tGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:3281029/62‑1 (MQ=255)                  ggTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGccc                      <  1:3611066/61‑1 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGc                        >  1:1058604/1‑52 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               <  1:1305200/61‑1 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               >  1:727188/1‑61 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               <  1:4515300/61‑1 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               <  1:4383107/61‑1 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               <  1:3829545/61‑1 (MQ=255)                         gCATACTGGTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTtgatga               <  1:3955989/61‑1 (MQ=255)                                ggTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATa       <  1:937331/62‑1 (MQ=255)                                ggTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATa       <  1:2684235/62‑1 (MQ=255)                                ggTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATa       <  1:2771013/62‑1 (MQ=255)                                ggTCGACCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATa       <  1:3541187/62‑1 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTg            >  1:313094/1‑52 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTg            >  1:1713381/1‑52 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTg            >  1:1706806/1‑52 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGaa  >  1:3406239/1‑62 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGaa  >  1:560202/1‑62 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGaa  >  1:1592658/1‑62 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGaa  >  1:3552621/1‑62 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGaa  >  1:3537300/1‑62 (MQ=255)                                     aCCGCCTCTGGTCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGa   >  1:1433947/1‑61 (MQ=255)                                                |                                                   CGGCTGAACAGAGCGATGGTTATCGCATACTGGTCGACCGCCTCTGGCCGCGCGGTATCAAAAAAACCGATTTAGCCCTTGATGAGTGGGATAAAGAA  >  W3110S.gb/1878654‑1878751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑