Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2472284	2472620	337	13 [0]	[0] 11	intS	predicted prophage CPS‑53 integrase

ATCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACAA  >  W3110S.gb/2472222‑2472283                                                              | aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:1053829/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:1177257/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:1283805/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:1367849/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:184812/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:281384/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:317302/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:379020/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:496219/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:584071/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:872194/62‑1 (MQ=255) aTCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:922286/62‑1 (MQ=255)   cGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACaa  <  1:1317809/60‑1 (MQ=255)                                                              | ATCGATCCTGTAAAGGCGAAAAAGGCTTCGTCTAACAACAATTCCTTTAGTGCGATTTACAA  >  W3110S.gb/2472222‑2472283

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑