Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2507868	2507869	2	35 [0]	[0] 15	ypdD	fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

CACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAG  >  W3110S.gb/2507806‑2507867                                                              | cacaGTAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:219760/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTTTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:298171/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:751444/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:491916/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:552547/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:640788/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:663655/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:676599/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:682047/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:739940/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1062848/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:763765/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:795951/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:831593/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:869299/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:895219/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:959946/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:98486/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:98527/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:451232/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:269035/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:26434/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1417932/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1412230/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1358506/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1356969/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1345431/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1247702/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1215166/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1141486/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1140164/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1139766/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1070353/62‑1 (MQ=255) cacaGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAg  <  1:1030059/62‑1 (MQ=255)          tGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAATGATATTCTCCAg  <  1:423367/53‑1 (MQ=255)                                                              | CACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAG  >  W3110S.gb/2507806‑2507867

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑