Missing coverage evidence...
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GCTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATAA  >  W3110S.gb/2529372‑2529433                                                              | gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCTATGCTCATaa  <  1:1419575/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:501673/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1459369/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1463679/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:153546/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:241416/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:256032/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:279924/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:461207/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:101018/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:590974/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:608359/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:642480/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:650611/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:675269/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:734935/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:765573/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:89554/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1417963/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1000864/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1037932/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1113451/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1202537/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1221885/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1303435/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1330070/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1363262/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1371306/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1409887/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:145781/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCGCATaa  <  1:1240165/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCGCATaa  <  1:243502/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGATCATaa  <  1:640274/62‑1 (MQ=255) gcTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATAGCGATGCTCATaa  <  1:757406/62‑1 (MQ=255)  cTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1237764/61‑1 (MQ=255)  cTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1124691/61‑1 (MQ=255)  cTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:94870/61‑1 (MQ=255)  cTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:972109/61‑1 (MQ=255)           aTAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATaa  <  1:1136950/52‑1 (MQ=255)                                                              | GCTCCCCCAGATAAAATATTGCAAAAAGGACATTACCTTTAAGCGCATCGCGATGCTCATAA  >  W3110S.gb/2529372‑2529433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑