Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2540994 2541011 18 16 [0] [0] 17 ptsI PEP‑protein phosphotransferase of PTS system

CCAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCT  >  W3110S.gb/2540933‑2540993
                                                            |
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1011211/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1034408/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1101096/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1131614/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1167170/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1436522/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:298211/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:359943/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:399669/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:407372/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:491198/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:753114/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:781112/61‑1 (MQ=255)
ccAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:926898/61‑1 (MQ=255)
 cAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:1228329/60‑1 (MQ=255)
 cAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCt  <  1:928329/60‑1 (MQ=255)
                                                            |
CCAGCCAATGTCACCGTCCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCT  >  W3110S.gb/2540933‑2540993

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: