Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2594754	2594764	11	38 [0]	[0] 56	ypfJ	conserved hypothetical protein

GCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCC  >  W3110S.gb/2594693‑2594753                                                             | gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCTGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:575469/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCCGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:581618/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:215997/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:215653/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:251545/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:3316/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:345399/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:359267/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:417651/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:427716/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:555766/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:600341/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:613263/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:656566/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:843444/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:879496/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:889530/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:968428/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:981384/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:212874/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1115677/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1125600/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1143571/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1146335/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1147392/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1202760/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1214077/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1239607/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:127364/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1353582/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1358572/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1393212/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1427020/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1434846/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1440456/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1453117/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:108002/1‑61 (MQ=255) gcgTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGACGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGcc  >  1:1343639/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCC  >  W3110S.gb/2594693‑2594753

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑