Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2705059	2705794	736	63 [0]	[0] 43	[lepA]	[lepA]

CGCACATACGAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTCGGC  >  W3110S.gb/2704998‑2705058                                                             | cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:71906/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1036251/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:390086/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:391684/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:394528/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:39621/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:435072/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:441182/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:503126/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:507329/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:539064/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:564231/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:590883/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:671991/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:676898/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:714872/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:369608/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:727721/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:758397/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:767039/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:783177/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:798765/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:832259/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:833300/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:839893/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:871143/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:926389/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:930306/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:951416/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:96723/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:969949/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1356052/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1037990/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1047107/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1133625/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1147712/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1189479/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1242276/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1250150/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1269315/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1289740/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1305243/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1309563/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1322745/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1323714/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1344286/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1345333/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:367162/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1400891/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1400953/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1408524/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1419438/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:153621/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:176297/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:1979/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:21804/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:238510/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:245376/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:297092/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:338234/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:342027/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGAGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:523533/1‑61 (MQ=255) cGCACATACCAGCCAGCCTAATTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTTGGc  >  1:564812/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGCACATACGAGCCAGCCTACTTCGCCACATTTCAGTTCAGTGCGGTCAACCTGTTTCGGC  >  W3110S.gb/2704998‑2705058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑